厚生労働省は1月17日、2014年第2週（1月6日～12日）のインフルエンザ発生状況を発表した。患者報告数は2万7,100件、定点当たり報告数は5.51と、前週から3倍近く増えた。沖縄県と大阪府で警報レベルを超えるなど、全47都道府県で増加し、推計患者数は約34万人となっている。 都道府県別の定点当たり報告数は、沖縄県（19.90）が最多で、鹿児島県（9.28）、岐阜県（8.91）、高知県（8.71）、和歌山県（8.10）、熊本県（8.06）、大分県（7.81）、宮崎県（7.66）、佐賀県（7.64）、静岡県（7.27）の順に高くなっている。 全国の保健所地域で警報レベルを超えているのは、大阪府と沖縄県の2か所。注意報レベルを超えているのは、23道府県の53か所。 定点医療機関からの報告をもとに推計したところ、定点以外を含む全国の医療機関をこの1週間に受診した患者数は約34万人。年代別では、30代が約6万人、20代と40代がそれぞれ約5万人、0～4歳、5～9歳がそれぞれ約4万人などとなっている。 基幹定点からのインフルエンザ患者の入院報告数は292例あり、第1週（2013年12月30日～2014年1月5日）の164例から倍増した。1～9歳（93例）、80歳以上（62例）など、子どもや高齢者を中心に入院報告数が多くなっている。
